Авторские права: © 2026 принадлежат авторам. Лицензиат: РНИМУ им. Н.И. Пирогова.
Статья размещена в открытом доступе и распространяется на условиях лицензии Creative Commons Attribution (CC BY).
Статья размещена в открытом доступе и распространяется на условиях лицензии Creative Commons Attribution (CC BY).
ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ
Разработка классификационных моделей для оценки ингибиторов вируса гриппа штамма A/H1N1 in silico
Информация об авторах
1 Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В. Н. Ореховича, Москва, Россия
2 Уфимский институт химии УФИЦ РАН, Уфа, Россия
3 Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург, Россия
Для корреспонденции: Леонид Алексеевич Столбов
ул. Погодинская, д. 10, стр. 8, г. Москва, 119121, Россия; ur.xednay@alvoblots
Информация о статье
Финансирование: модели зависимостей «структура–активность» построены при поддержке программы фундаментальных научных исследований в Российской Федерации на долгосрочный период (2021–2030 гг.) (№ 124050800018-9). Подготовка базы данных проводилась в рамках государственного задания «Кинетическое, спектрально-люминесцентное и теоретическое исследование ключевых интермедиатов в химических и биохимических процессах окисления» УфИХ УФИЦ РАН № 125020601626-9.
Вклад авторов: Л. А. Столбов — анализ данных, построение моделей, подготовка рукописи; С. С. Борисевич — идея, подготовка базы данных; Я. В. Горохов — анализ научной литературы с целью сбора базы данных; В. В. Зарубаев — предоставление актуальных результатов биологического тестирования; О. А. Тарасова — идея и методология исследования; В. В. Поройков — методология исследования. Все авторы принимали участие в подготовке и редактировании рукописи.
Статья получена: 29.01.2026
Статья принята к печати: 10.05.2026
Опубликовано online: 15.06.2026
|
Рис. 1. Характеристика точности моделей — площади под ROC-кривой (AUC-ROC) на этапе валидации при различных порогах определения активных соединений для А) IC50, Б) CC50, В) SI, пунктирная линия соответствует выбранной модели
Рис. 2. Валидационные AUC ROC кривые для моделей А) IC50 при пороге 5 мкг/мл, Б) CC50 при пороге 300 мкг/мл, В) SI при пороге 200
Рис. 3. Структуры из независимой тестовой выборки: А, Б — выделенный скаффолд встречается в активных (или вообще в любых) соединениях,
содержащихся в базе данных; В — выделенный скаффолд не встречается ни в одном соединении используемой при обучении базы данных
Рис. 4. Валидация прогностической модели. Соединения описаны в работе [21]. Значения IC50, приведенные на рисунке, соответствуют экспериментальным значениям, значение SI200 соответствует прогнозу при пороге SI = 200, SI8 соответствует прогнозу при пороге SI = 8
Рис. 5. Валидация прогностической модели. Нумерация соединений соответствует оригинальной нумерации, представленной в научных статьях [19–22].
Значения IC50 и SI, приведенные на рисунке, соответствуют экспериментальным значениям, значение SI200 соответствует прогнозу. Соединения, прогноз по которым корректен, представлены в зеленых рамках, неверный и сомнительный прогнозы представлены в красной и желтой рамке соответственно
